المقاربة الشبكية متعددة الاهداف لامراض العدوى والاستجابة المناعية الحادة

Abstract

Cette étude vise à analyser le Cluster 5 — Infectious & Acute Immune Response en tant que regroupement analytique englobant des états pathologiques et des réponses biologiques associés aux infections et à la réponse immunitaire aiguë, en s'appuyant sur une approche de pharmacologie en réseau. Elle repose sur l'hypothèse que les infections et l'inflammation aiguë constituent des phénomènes complexes qui ne peuvent être expliqués par un seul facteur ou une unique voie biologique, mais résultent d'un réseau d'interactions entre l'agent pathogène, l'hôte, les gènes, les cytokines, les processus inflammatoires et les mécanismes de remodelage tissulaire. La méthodologie a consisté à traiter et à nettoyer un jeu de données primaire de type maladie– plante–composé, puis à faire correspondre les composés et à récupérer les relations d'activité biologique à partir de la base de données ChEMBL. Les gènes ont ensuite été associés aux contextes pathologiques à l'aide de la plateforme Open Targets. Un réseau analytique de type Plant– Compound–Gene–Disease module a été construit afin de mettre en évidence les relations potentielles entre les plantes médicinales, les composés naturels, les gènes et les états pathologiques appartenant à ce regroupement. Des indicateurs de couverture et de complétude du réseau ont également été utilisés pour classer les plantes, les composés et les gènes, tout en distinguant les composés validés (« clean compounds ») des composés présentant une alerte interprétative. Les résultats ont permis d'identifier sept modules pathologiques ou de réponse biologique, six plantes principales ou secondaires, seize composés validés, onze composés présentant une alerte interprétative, ainsi que vingt et un axes géniques. Parmi les plantes les plus importantes figurent Curcuma longa, Camellia sinensis et Allium sativum. Les principaux composés identifiés comprennent plusieurs flavonoïdes et polyphénols tels que la quercétine, l'apigénine, la lutéoline, la curcumine, le kaempférol, le resvératrol et l'EGCG. Les résultats ont également mis en évidence des axes géniques majeurs, notamment PTGS2, MAPK1, TNF, NLRP3 et les MMPs, étroitement impliqués dans l'inflammation, la régulation de la réponse immunitaire et le remodelage des tissus. Cette étude souligne que ces résultats constituent des hypothèses de recherche structurées plutôt que des preuves directes d'efficacité thérapeutique. En effet, la couverture du réseau, à elle seule, ne permet pas de démontrer l'efficacité, l'innocuité ou le potentiel pharmacologique des composés étudiés. En conséquence, les résultats obtenus sont proposés comme une feuille de route préliminaire orientant des travaux futurs, notamment l'évaluation des propriétés pharmacocinétiques et toxicologiques (ADME/ADMET), les études de docking moléculaire, les simulations de dynamique moléculaire et les validations expérimentales.